Desa Semangko adalah bagian integral dari Kecamatan Marang kayu dengan Luas wilayah ± 18.500 Ha berada pada 131º12 BT dan 0º12” LU dan berada diatas permukaan laut ± 0-12 m DPL. Desa Semangko memiliki 5 (lima) Dusun dengan 13 (tiga belas) Rukun Tetangga ( RT ) yang berbatasan dengan wilayah-wilayah administratif sebagai berikut :

Batas Sebelah Utara                        : Desa Kersik

Batas Sebelah Selatan                     : Desa Sebuntal

Batas Sebelah Barat                        : Desa Safari/Mulawarman (Tenggarong Seberang)

Batas Sebelah Timur                       : Selat Makassar